Un an a passé depuis le scandale Stormfront. Les Boys travaillent comme sous-traitants pour le Bureau fédéral des affaires surhumaines de Victoria Neuman. Sous la supervision de Hughie Campbell, ils se consacrent désormais à la traque et à l'arrestation des brebis galeuses parmi les super-héros. Annie est chargée par Stan Edgar, le PDG de Vought, d'améliorer l'image de l'entreprise...

Alors que les Boys enquêtent sur la mort du Petit Soldat, Hughie se rend dans un orphelinat qui accueille des enfants dotés de super-pouvoirs. Il copie discrètement le contenu du disque dur de la directrice de l'établissement et découvre ainsi que Victoria Neuman est la fille adoptive d'Edgar...

Contre toute attente, le discours du Protecteur lui vaut de voir sa cote de popularité s'envoler auprès des hommes blancs et ruraux. Autre conséquence positive pour lui : les dirigeants de Vought diminuent leur surveillance et lui laissent les coudées franches. Le Protecteur se pense désormais intouchable...

Butcher négocie avec Nina le départ des Boys pour la Russie en échange d'un assassinat ciblé. Lorsqu'il apprend l'existence du V24, Hughie demande à Butcher la permission de l'utiliser, mais celui-ci refuse. Hughie vole alors une dose et l'utilise pour tuer un des soldats russes qui gardent un laboratoire secret...

Les Boys sont encore sous le choc de leur découverte en Russie. Ils apprennent de la bouche de la Légende que le Petit Soldat veut se venger de la Comtesse Rouge et décident de la capturer pour l'utiliser comme appât. Kimiko est hospitalisée dans un état critique, ce qui provoque l'inquiétude du Français...

L'Homme-Poisson et le Protecteur découvrent des images de vidéosurveillance montrant le Petit Soldat en train de tuer la Comtesse Rouge. Nina kidnappe Kimiko et Cherie, l'ex. Elle contraint ensuite le Français à choisir laquelle des deux femmes aura la vie sauve. Mais Kimiko parvient à se libérer...

Alors qu'il se terre dans une pizzeria abandonnée, Black Noir a des visions. Les mascottes de la chaîne de restaurants reconstituent devant ses yeux les scènes de sévices qu'il a subis aux mains du Petit Soldat ainsi que l'embuscade au Nicaragua. La greffe cardiaque est un succès et A-Train se réveille...

Le Protecteur retrouve Ryan et se réconcilie avec lui. Ne voulant pas nuire davantage à Hughie, Butcher, qui est gravement malade à cause de son utilisation du V24, part à New York avec le Petit Soldat. Le Protecteur se venge cruellement de Black Noir qui lui avait caché qu'il est le fils de Petit Soldat...