L'équipe du S.W.A.T. collabore avec le lieutenant Piper Lynch pour arrêter un criminel qui utilise des drones comme bombes. Par ailleurs, le premier jour d'Hondo en tant que tuteur légal de Darry se complique lorsque son père vient s'installer à l'improviste.

Le maire charge Piper d'évaluer l'équipe du S.W.A.T.. Pendant ce temps, Hondo et ses hommes traquent Ruth Pearson, une dangereuse fugitive. Ils craignent qu'elle parvienne à mettre en oeuvre un suicide collectif de fidèles. Parallèlement, Luca demande à l'équipe de l'aider dans son nouveau projet de food truck avec des spécialités guatémaltèques, mais personne n'a d'argent à lui prêter.

La lieutenant Piper Lynch vient d'arriver dans l'équipe. Chargée d'une enquête sur un gang de faux-monnayeurs, la jeune recrue entraîne les autres dans une opération clandestine. Mais elle ne leur laisse pas assez de temps pour préparer cette mission délicate et, ce faisant, se met le commandant à dos. Parallèlement, Hondo subit des tensions à la maison : la situation entre ses parents empire.

La famille de Deacon se retrouve impliquée dans la nouvelle affaire de l'équipe : un cartel de drogue colombien dont le chef est sous protection de la CIA. Tan est convoqué devant le comité de révision interne après une indiscrétion de sa petite amie. Hondo apprend des nouvelles inquiétantes concernant son père.

Un gang jamaïcain dérobe le contenu d'un camion rempli d'armes d'assaut de la police destinées à la destruction. Les malfaiteurs projettent de les revendre à plusieurs gangs de Long Beach. Cette enquête amène Hondo à renouer avec son frère adoptif Nate. Pendant ce temps, le projet de food truck de Luca semble bien parti. Un diagnostic est enfin posé concernant la santé déclinante du père de Hondo.

La soeur aînée de Hondo rend visite à la famille pour voir son père malade. Or, tout le monde était sans nouvelles d'elle depuis des années. La famille se réunit pour discuter de la situation. Par ailleurs, les agents sont à la recherche d'un militant des droits de l'homme, qui a été victime d'un enlèvement...

Les membres de l'équipe sont à la recherche de braqueurs en fuite, armés d'une lance thermique capable de presque tout sectionner. Chris demande conseil à Deacon car sa relation avec Kira et Ty est très tendue. Quant à Street, il tente de trouver le courage de dire à Hicks qu'il sort avec sa fille Molly...

L'équipe du S.W.A.T. mène des négociations tendues avec une famille menacée d'expulsion, et qui a pris un officier en otage. Pendant ce temps, Hondo aide son père, qui vient d'avoir des soucis de santé. La relation entre Chris, Kira et Ty se trouve à un tournant critique...

Les membres de l'équipe doivent s'associer à une division chargée de la criminalité organisée de Los Angeles. Ils mettent tout en oeuvre pour retrouver un officier, kidnappé au cours d'une mission secrète ratée. Chris tente de réconforter les parents du policier enlevé, car on leur interdit l'accès à certains détails de l'enquête...

L'équipe doit assurer la sécurité d'un chef de guerre au cours de son extradition par la Cour pénale internationale. Le père de Hondo tente de faire amende honorable auprès de Charice. Le frère adoptif de Street, Nate, demande de l'aide, tandis que Deacon accepte de faire une thérapie, pour sa fille Lila...

Un groupe de cinq hommes masqués braque un casino. Hondo et son équipe sont dépêchés mais à leur arrivée, quatre malfaiteurs ont déjà pris la fuite avec le butin et un complice est tué lors de l'intervention. Les hommes du S.W.A.T. parviennent à retrouver l'un des braqueurs, qui accepte de coopérer...

Street parvient à infiltrer le réseau de trafic de drogue de Nolan. Mais il lui reste encore à découvrir qui est son fournisseur et la date de la prochaine livraison. Il s'invite alors à une réunion à laquelle il n'est pas convié et rencontre enfin Ludlow, le fournisseur de Nolan. Il découvre alors où et quand aura lieu la livraison...

Hondo, Deacon, Tan et le commandant Hicks escortent un fugitif extradé au Japon. Lorsque celui-ci parvient à s'échapper, les agents se lancent dans une véritable chasse à l'homme à travers Tokyo. Pendant ce temps, à Los Angeles, les autres membres de l'unité recherchent les contacts du criminel...

Le S.W.A.T recherche un lien entre les victimes d'un tireur isolé qui s'en prend uniquement à des femmes. Le tueur est membre d'un forum masculiniste et exécute les désirs de vengeance d'internautes. Luca participe à une enquête sur un homicide dans son quartier. Quant à Lynch, il pousse Chris à accepter une interview télévisée...

Pour boucler ses fins de mois, Deacon a un deuxième emploi de garde de sécurité. Au cours d'un match de boxe de haut niveau dont il assure la sécurité, il se retrouve pris au milieu d'une affaire de kidnapping. Darryl est frustré qu'Hondo soit privé de ses droits paternels. Tan décide de présenter Bonnie à sa mère...

Le SWAT se lance à la recherche d'un adolescent. Leur enquête les mène jusqu'à une personne bénéficiant du programme de protection des témoins. Hondo se dispute avec sa petite amie au sujet d'une conférencière invitée au centre communautaire. De son côté, Luca craint de ne pas être physiquement apte à la reprise du travail de terrain...

Le S.W.A.T. doit réparer les dégâts après une opération de police qui a mal tourné. Les chefs des gangs les plus dangereux de Los Angeles sont regroupés dans un hôtel rempli de civils. Ils sont prêts à tout pour s'échapper. Luca, qui a bien d'autres soucis en tête, doit en outre raisonner son frère Terry...

Buck, l'ancien chef de l'escouade 20, ne répond plus au téléphone. L'équipe, et particulièrement Hondo, craint qu'il n'attente à sa vie. Tout porte à croire que l'officier ne s'est jamais remis de son erreur, qui avait coûté la vie à un civil. L'enquête pour le retrouver va mettre en lumière sa descente aux enfers...

L'équipe traque un prisonnier qui a réussi à s'évader. Sa capture est d'autant plus importante qu'il a ouvertement annoncé qu'il souhaitait abattre Tan ainsi que toutes les autres personnes ayant participé à son arrestation et à son incarcération. Chris réalise à quel point la loi n'est pas égale pour tous...

Chris n'accepte pas que le fils de l'adjoint au maire qu'elle avait arrêté alors qu'il conduisait en état d'ébriété s'en sorte sans encombre. Elle se lance dans un combat qui semble perdu d'avance. Par ailleurs, le SWAT se lance à la poursuite d'un couple qui sème la mort...

Informée du lieu et de l'heure de l'atterrissage d'un avion chargé de drogue, l'équipe, secondée par la brigade des stups, tente d'interpeler les trafiquants. Mais l'avion les repère et redécolle avant de s'écraser un peu plus loin, dans la banlieue de Los Angeles. La traque continue alors au sol...