Des agents d'élite du FBI ont pour mission de voyager à travers le monde afin de protéger les citoyens américains où qu'ils soient.

La Fly Team est appelée en renfort lorsque Katya Milgrava, une jeune mère, s'enfuit en Hongrie avec son fils après en avoir perdu la garde aux Etats-Unis. Alors qu'il sont à deux doigts de l'interpeller, Scott et Kellet assistent, impuissants, à l'enlèvement de l'enfant dans une rue de Budapest.

En Suisse, un couple de détectives privés américain est attaqué dans son véhicule. L'homme est tué tandis que la femme parvient à prendre la fuite, mais est grièvement blessée. La Fly Team découvre que les deux victimes transportaient plusieurs millions de dollars de cryptomonnaie appartenant à un milliardaire.

L'équipe enquête sur Drew Edmonson, un citoyen américain, qui clame son innocence après s'être réfugié à l'ambassade américaine de Madrid couvert du sang de son petit ami espagnol, Rafael Delgado. La famille de ce dernier, tout comme la police espagnole, est convaincue de la culpabilité d'Edmonson.

L'équipe enquête sur la mort de Philip Blake, un journaliste américain, empoisonné alors qu'il tentait d'entrer en contact avec une source anonyme en Pologne. La CIA informe les agents que Blake se documentait sur un système d'armement russe top secret. Pendant l'opération, Kellett reproche à Forrester de se montrer trop protecteur avec elle.

Bridget Rapp, une négociatrice des services de renseignement américains qui participait à des négociations avec l'Iran, est portée disparue à Paris. Son appartement est saccagé et couvert de traces de sang. La Fly Team découvre que Bridget entretenait une liaison avec son homologue iranien.

Lloyd Eckersley, l'un des deux fondateurs américains d'un site illégal pour adultes, est assassiné à Prague. L'équipe est chargée de retrouver Fred Dobbins, le cofondateur de la plateforme, qui est en fuite en République tchèque. Arrêté, celui-ci nie toute implication dans la mort d'Eckersley.

Un attentat à la bombe est commis lors d'un festival à Budapest. Plusieurs Américains font partie des victimes, parmi lesquels le nouveau petit ami de Cameron Vo, qui a été grièvement blessé. L'équipe de Scott Forrester tente de retrouver les terroristes avant qu'ils ne perpètrent une nouvelle attaque...

Un groupe de terroristes albanais prend d'assaut une salle de spectacle à Sofia, en Bulgarie, en plein concert. Le public, qui compte quinze étudiants américains, est pris en otage. Les assaillants exigent une rançon de dix millions de dollars en crypto-monnaie et n'acceptent de négocier qu'avec le FBI...

C'est à contrecoeur que Kellett et l'équipe du FBI se joignent à une enquête en cours à Belfast, en Irlande du Nord. Liam Walsh, un informateur de Kellett, a en effet été arrêté, soupçonné d'être impliqué dans le meurtre de Brianna Quinn, un officier de police. Clamant son innocence, Walsh est prêt à révéler des informations sur un réseau de contrebande d'armes de l'IRA.

Mark Douglas, un officier de la police de New York, est arrêté en Transnistrie pour coups et blessures. Cet Etat n'étant pas reconnu par l'ONU, Europol et le FBI n'ont pas de contact sur place, ce qui va compliquer l'enquête de la Fly Team. Douglas affirme qu'il s'est rendu dans ce territoire pour infiltrer un réseau de trafic sexuel couvert par des personnes haut placées.

Soupçonné d'avoir tué un de ses voisins à Francfort, Michael Vestal, un magnat américain de la technologie adepte des théories conspirationnistes, prend la fuite. Alors que la Fly Team se rend en Allemagne pour l'arrêter, une rumeur se propage sur les réseaux sociaux : la police locale et le FBI auraient piégé Vestal pour le faire taire.

James et Fiona Delvina, un couple accusé d'avoir monté une escroquerie de plusieurs millions de dollars durant la pandémie de Covid-19, s'enfuit en Albanie en abandonnant ses enfants aux Etats-Unis. La Fly Team se rend à Tirana pour les arrêter. Sur ordre de Forrester, les enfants du couple sont emmenés en Albanie pour tenter de faire plier leurs parents.

Rebecca Blair, la procureure générale des Etats-Unis, se rend à Budapest pour assister à une réunion importante avec son homologue hongrois. Leur entretien concerne l'extradition de John Mallory, un lanceur d'alerte américain. Lorsqu'un des assistants de Blair est assassiné, la Fly Team est chargée de la protéger et de trouver l'origine de la menace qui pèse sur elle.

Jordan, la soeur de Raines, voyage en Europe avec des amis. A leur arrivée au Kosovo, ils sont kidnappés et l'un des membres du groupe est tué. Pour retrouver Jordan, Raines est prêt à tout, y compris à mettre son travail et sa vie en jeu. Sur place, il est aidé par un policier local. Tous deux apprennent que Jordan et l'une de ses amies ont été enlevées à des fins de trafic sexuel.

A Budapest, Cameron Vo retrouve Nick Thorpe, un ami d'enfance diplômé de Quantico. Immédiatement après leur rendez-vous, la jeune femme entend des coups de feu : un régulateur de jeu est assassiné. Alors que Cameron est soupçonné d'être l'auteur de ce meurtre, Thorpe, lui, demeure introuvable.

Daniel Spencer, un vigneron américain installé en France, est tué par balle sur son domaine viticole, en Occitanie. La Fly Team soupçonne un groupe de manifestants qui s'oppose au rachat de terres agricoles par des étrangers. Si le leader des protestataires nie toute implication dans le meurtre, les indices contredisent ses affirmations.

Un bateau de croisière américain naviguant sur le Danube est attaqué par des hommes lourdement armés. Au lendemain de cet assaut sanglant, la Fly Team se rend à Vienne. Les agents découvrent rapidement que le bateau transportait de l'héroïne appartenant à un puissant cartel des Balkans. Qui, parmi les employés de la compagnie, est impliqué dans ce trafic ?

Christopher Staton, un scientifique américain, est tué par un sniper dans son laboratoire biomédical de Bruxelles. La Fly Team et les forces de police belges découvrent que le tueur est un certain Patrick Jans, un ancien tireur d'élite de l'armée. Celui-ci, qui ne cache pas ses accointances avec l'extrême droite, visait en fait le directeur du laboratoire, Luc Michaud.

Le fils de Gabriel Watts, un milliardaire américain, est retrouvé inconscient dans son appartement de Berlin. Le jeune homme a fait une overdose. La Fly Team enquête aux côtés de la police locale, mais découvre que les forces de l'ordre allemande rendent des comptes à une agence de détectives privés.

Un jet transportant des citoyens américains, parmi lesquels l'homme d'affaires Greg Hutchinson, est abattu au-dessus d'une petite ville polonaise. La mère de Forrester se mêle de l'enquête de la Fly Team, conseillant à son fils de s'intéresser à Pavel Novikoff, un informateur russe qui travaillait au Kremlin et est actuellement en fuite.